vendredi 5 mars 2021

Profil bactériologique des infections respiratoires basses : Etude rétrospective de 2015 à 2018


Djedjig F(1), Nait Kaci A(2), Amrani R(2), Lafer O(1), Hasnaoui S(1), Chemli S(1), Senouci H(1), Benamrouche N(1), Bouheraoua S(1), Aoudia N(1), Tali Maamar H(1).
1) Laboratoire de Bactériologie Médicale et la Surveillance de la Résistance aux Antibiotiques, Institut Pasteur d’Algérie.
2) Faculté des Sciences Biologiques, Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene
E-mail :  DJEDJIG F: djedjig.fatiha@hotmail.fr
E-mail : NAITKACI A: nait.nissa94@gmail.com
E-mail : AMRANI R: amr.rasha@gmail.com
E-mail : LAFER O: laferourida@yahoo.fr
E-mail : HASNAOUI S: sonia_hasnaoui@hotmail.com
E-mail : CHEMLI S: samiachemli@gmail.com
E-mail : SENOUCI H: evasiondz@yahoo.fr
E-mail : BENAMROUCHE N: n_benamrouche@yahoo.fr
E-mail : BOUHERAOUA S: bouheraoua.selma@hotmail.fr
E-mail : AOUDIA N: nawelaoudia@yahoo.fr

E-mail : TALI MAAMAR H: htali@yahoo.fr

 

RÉSUMÉ :
Les infections des voies respiratoires basses (IRB) représentent une cause importante de morbi-mortalité dans le monde  et sont un motif fréquent de prescription d’antibiotiques. L’objectif de notre étude est de déterminer les bactéries qui sont à l’origine des IRB chez l’enfant et l’adulte et déterminer les profils de résistances des germes isolés. Il s’agit d’une étude rétrospective allant du 1er janvier 2015 au 31 Mars 2018 portant sur 967 prélèvements réalisés, chez 802 malades, il s’agit de  313 prélèvements respiratoires pour  diagnostic bactériologique par culture, 401 prélèvements sanguins pour diagnostic sérologique (Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Chlamydia pneumoniae) et 253 urines pour  recherche d’antigène urinaire de Legionella pneumophila et Streptococcus pneumoniae. Résultats: le diagnostic bactériologique est positif dans 29% des cas (234/802). L’âge moyen est 41 ans. Pour les pneumopathies communautaires, on retrouve Mycoplsma pneumoniae (15.5%), Chlamydia pneumoniae (12.3%) Haemophilus influenzae (10.5%), Klebsiella pneumoniae (10.9%), Pseudomonas aeruginosa (10%), Streptococcus pneumoniae (9.5%), Moraxella catarrhalis (7.3%), Legionella pneumophila (6.5%). Pour les pneumopathies nosocomiales les germes les plus retrouvées sont Pseudomonas aeruginosa (27.5%), Acinetobacter baumannii (20%), Klebsiella pneumoniae (15%). La résistance varie selon  l’espèce bactérienne, la  plupart des souches sont sensibles mais il existe des isolats multi résistants (A.baumannii). Les résultats retrouvés sont concordant avec les données de littérature. S.pneumoniae; M.pneumoniae ; C.pneumoniae  sont  les plus incriminés dans les pneumopathies communautaires; L.pneumophila est impliqués dans moins de 5% des cas en dehors des épidémies. P.aeruginosa, les entérobactéries et S.aureus sont retrouvés chez les personnes âgées. La prédominance des germes retrouvés dans les infections nosocomiales est liée à  l’écologie bactérienne de l’environnement hospitalier. La résistance des bactéries isolées lors de pneumopathies communautaires est faible mais celles responsables de pneumopathies nosocomiales est élevée. En conclusion, la connaissance des germes responsables d’IRB est très importante et permet d’orienter l’antibiothérapie probabiliste.
Mots clés : Bactéries pneumopathies communautaires, Pneumopathie nosocomiale, Diagnostic bactériologique, Résistance aux antibiotiques.



ABSTRACT: BACTERIOLOGICAL PROFILE OF LOW RESPIRATORY TRACT INFECTIONS: A retrospective study from 2015 to 2018.
Lower Respiratory Tract Infections (LRTI) are a major cause of morbidity and mortality worldwide and are a very common cause of antibiotic prescription. The objective of our study is to determine bacterial agents causing LRTI in children and adults and to determine the antimicrobial resistance patterns of the etiological agents. This is a retrospective study from January 1, 2015 to March 31, 2018 on 967 samples obtained from 802 patients, it’s about 313 respiratory samples for bacteriological diagnosis by culture, 401 blood samples for a serological diagnosis (Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Chlamydia pneumoniae) and 253 urine specimens for detection of urinary antigen of Legionella pneumophila and Streptococcus pneumoniae. Results: Of the 802 patients, bacterial diagnosis is positive in 29% of cases (234/802). The average age is 41 years [2 months-88 years]. Community-acquired pneumonia includes Mycoplsma pneumoniae (15.5%), Chlamydia pneumoniae (12.3%) Haemophilus influenzae (10.5%), Klebsiella pneumoniae (10.9%), Pseudomonas aeruginosa (10%), Streptococcus pneumoniae (9.5%), Moraxella catarrhalis (7.3%), Legionella pneumophila (6.5%). For the nosocomial pneumopathies, the most found germs are Pseudomonas aeruginosa (27.5%), Acinetobacter baumannii (20%), Klebsiella pneumoniae (15%). Resistance varies by bacterial species, most strains are susceptible but there are multi-resistant isolates (A.baumannii). The results found are consistent with the literature data. S. pneumoniae; M. pneumoniae; C. pneumoniae are the most incriminated in community-acquired pneumonia; L. pneumophila is involved in less than 5% of cases outside epidemics. P.aeruginosa, enterobacteria and S. aureus play a significant role in the elderly. The predominance of germs found in nosocomial infections is related to the bacterial ecology of the hospital environment. The resistance of bacteria isolated during community-acquired pneumonia is low, but those responsible for nosocomial pneumopathies are high. Conclusion: The knowledge of the germs responsible for LTRI is very important and can guide probabilistic antibiotherapy.
Key words:  Community pneumopathy Bacteriol, Nosocomial pneumopathy, Bacteriological diagnosis, Antibiotic resistance.